Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCC1Q96CN9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms