Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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FAM3DQ96BQ1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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FAM3DQ96BQ1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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FAM3DQ96BQ1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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FAM3DQ96BQ1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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FAM3DQ96BQ1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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FAM3DQ96BQ1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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FAM3DQ96BQ1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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FAM3DQ96BQ1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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FAM3DQ96BQ1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
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