Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC59Q96AG4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
LRRC59Q96AG4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
LRRC59Q96AG4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC59Q96AG4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC59Q96AG4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC59Q96AG4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC59Q96AG4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC59Q96AG4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC59Q96AG4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC59Q96AG4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC59Q96AG4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC59Q96AG4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC59Q96AG4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC59Q96AG4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC59Q96AG4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC59Q96AG4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC59Q96AG4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC59Q96AG4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC59Q96AG4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC59Q96AG4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC59Q96AG4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC59Q96AG4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC59Q96AG4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC59Q96AG4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC59Q96AG4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC59Q96AG4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC59Q96AG4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC59Q96AG4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC59Q96AG4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC59Q96AG4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC59Q96AG4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC59Q96AG4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC59Q96AG4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC59Q96AG4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC59Q96AG4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC59Q96AG4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC59Q96AG4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC59Q96AG4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms