Protein–RNA interactions for Protein: Q96A59

MARVELD3, MARVEL domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARVELD3Q96A59 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 ETFRF1-205ENST00000555711 783 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MARVELD3Q96A59 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MARVELD3Q96A59 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MARVELD3Q96A59 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MARVELD3Q96A59 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MARVELD3Q96A59 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MARVELD3Q96A59 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MARVELD3Q96A59 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MARVELD3Q96A59 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MARVELD3Q96A59 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MARVELD3Q96A59 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MARVELD3Q96A59 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MARVELD3Q96A59 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MARVELD3Q96A59 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MARVELD3Q96A59 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MARVELD3Q96A59 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MARVELD3Q96A59 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MARVELD3Q96A59 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MARVELD3Q96A59 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MARVELD3Q96A59 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MARVELD3Q96A59 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MARVELD3Q96A59 IFNA1-201ENST00000276927 863 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MARVELD3Q96A59 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MARVELD3Q96A59 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MARVELD3Q96A59 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MARVELD3Q96A59 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MARVELD3Q96A59 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MARVELD3Q96A59 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MARVELD3Q96A59 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MARVELD3Q96A59 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MARVELD3Q96A59 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MARVELD3Q96A59 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MARVELD3Q96A59 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MARVELD3Q96A59 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MARVELD3Q96A59 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms