Protein–RNA interactions for Protein: Q96A49

SYAP1, Synapse-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYAP1Q96A49 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYAP1Q96A49 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms