Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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