Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKL1Q969V6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms