Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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