Protein–RNA interactions for Protein: Q92743

HTRA1, Serine protease HTRA1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA1Q92743 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HTRA1Q92743 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HTRA1Q92743 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms