Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms