Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ0

HAVCR2, Hepatitis A virus cellular receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR2Q8TDQ0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HAVCR2Q8TDQ0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms