Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HELQQ8TDG4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HELQQ8TDG4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HELQQ8TDG4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HELQQ8TDG4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HELQQ8TDG4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HELQQ8TDG4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HELQQ8TDG4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HELQQ8TDG4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HELQQ8TDG4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HELQQ8TDG4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HELQQ8TDG4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HELQQ8TDG4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HELQQ8TDG4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HELQQ8TDG4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HELQQ8TDG4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HELQQ8TDG4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HELQQ8TDG4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HELQQ8TDG4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HELQQ8TDG4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HELQQ8TDG4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HELQQ8TDG4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HELQQ8TDG4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HELQQ8TDG4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HELQQ8TDG4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HELQQ8TDG4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HELQQ8TDG4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HELQQ8TDG4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HELQQ8TDG4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HELQQ8TDG4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HELQQ8TDG4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HELQQ8TDG4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HELQQ8TDG4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HELQQ8TDG4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HELQQ8TDG4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HELQQ8TDG4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HELQQ8TDG4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HELQQ8TDG4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HELQQ8TDG4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HELQQ8TDG4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HELQQ8TDG4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HELQQ8TDG4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms