Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF398Q8TD17 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms