Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR3

SPTSSB, Serine palmitoyltransferase small subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSBQ8NFR3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SPTSSBQ8NFR3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms