Protein–RNA interactions for Protein: Q8NET6

CHST13, Carbohydrate sulfotransferase 13, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST13Q8NET6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHST13Q8NET6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHST13Q8NET6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHST13Q8NET6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHST13Q8NET6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST13Q8NET6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST13Q8NET6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST13Q8NET6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST13Q8NET6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST13Q8NET6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST13Q8NET6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST13Q8NET6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST13Q8NET6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST13Q8NET6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST13Q8NET6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST13Q8NET6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST13Q8NET6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST13Q8NET6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms