Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
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