Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms