Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00301Q8NCQ3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms