Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN4

RNF169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF169Q8NCN4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
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RNF169Q8NCN4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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RNF169Q8NCN4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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RNF169Q8NCN4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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RNF169Q8NCN4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
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RNF169Q8NCN4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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RNF169Q8NCN4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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RNF169Q8NCN4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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RNF169Q8NCN4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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