Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms