Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSGALNACT2Q8N6G5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSGALNACT2Q8N6G5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSGALNACT2Q8N6G5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSGALNACT2Q8N6G5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSGALNACT2Q8N6G5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSGALNACT2Q8N6G5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSGALNACT2Q8N6G5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSGALNACT2Q8N6G5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSGALNACT2Q8N6G5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSGALNACT2Q8N6G5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSGALNACT2Q8N6G5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSGALNACT2Q8N6G5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSGALNACT2Q8N6G5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSGALNACT2Q8N6G5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSGALNACT2Q8N6G5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSGALNACT2Q8N6G5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CSGALNACT2Q8N6G5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSGALNACT2Q8N6G5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSGALNACT2Q8N6G5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSGALNACT2Q8N6G5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSGALNACT2Q8N6G5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSGALNACT2Q8N6G5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSGALNACT2Q8N6G5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSGALNACT2Q8N6G5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSGALNACT2Q8N6G5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSGALNACT2Q8N6G5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSGALNACT2Q8N6G5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSGALNACT2Q8N6G5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSGALNACT2Q8N6G5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSGALNACT2Q8N6G5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSGALNACT2Q8N6G5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSGALNACT2Q8N6G5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSGALNACT2Q8N6G5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSGALNACT2Q8N6G5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSGALNACT2Q8N6G5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSGALNACT2Q8N6G5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSGALNACT2Q8N6G5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms