Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms