Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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CLIP4Q8N3C7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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CLIP4Q8N3C7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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CLIP4Q8N3C7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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