Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ96

CMTM1, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1Q8IZ96 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMTM1Q8IZ96 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms