Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC83Q8IWF9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC83Q8IWF9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms