Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KNDC1Q76NI1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KNDC1Q76NI1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KNDC1Q76NI1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KNDC1Q76NI1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KNDC1Q76NI1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KNDC1Q76NI1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KNDC1Q76NI1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
KNDC1Q76NI1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KNDC1Q76NI1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
KNDC1Q76NI1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KNDC1Q76NI1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KNDC1Q76NI1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KNDC1Q76NI1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KNDC1Q76NI1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
KNDC1Q76NI1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KNDC1Q76NI1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KNDC1Q76NI1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KNDC1Q76NI1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KNDC1Q76NI1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KNDC1Q76NI1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KNDC1Q76NI1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KNDC1Q76NI1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KNDC1Q76NI1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KNDC1Q76NI1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
KNDC1Q76NI1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KNDC1Q76NI1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KNDC1Q76NI1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KNDC1Q76NI1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KNDC1Q76NI1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms