Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRCAPQ6ZRS2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms