Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC141Q6ZP82 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC141Q6ZP82 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC141Q6ZP82 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC141Q6ZP82 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC141Q6ZP82 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC141Q6ZP82 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC141Q6ZP82 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC141Q6ZP82 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC141Q6ZP82 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC141Q6ZP82 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC141Q6ZP82 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC141Q6ZP82 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC141Q6ZP82 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC141Q6ZP82 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC141Q6ZP82 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC141Q6ZP82 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC141Q6ZP82 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC141Q6ZP82 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC141Q6ZP82 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms