Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P435 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P435 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P435 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P435 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P435 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6P435 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6P435 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6P435 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6P435 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6P435 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6P435 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6P435 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6P435 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6P435 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6P435 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6P435 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6P435 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6P435 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6P435 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6P435 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6P435 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6P435 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6P435 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6P435 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6P435 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6P435 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6P435 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6P435 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6P435 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6P435 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6P435 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6P435 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6P435 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6P435 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6P435 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q6P435 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6P435 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6P435 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6P435 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6P435 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6P435 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6P435 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6P435 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6P435 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6P435 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6P435 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6P435 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6P435 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6P435 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6P435 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6P435 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6P435 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6P435 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6P435 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6P435 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6P435 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6P435 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6P435 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6P435 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6P435 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6P435 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6P435 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6P435 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6P435 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6P435 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6P435 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6P435 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6P435 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6P435 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6P435 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6P435 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6P435 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6P435 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6P435 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6P435 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6P435 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6P435 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6P435 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6P435 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6P435 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6P435 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6P435 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6P435 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6P435 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6P435 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6P435 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6P435 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6P435 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6P435 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6P435 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6P435 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6P435 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6P435 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6P435 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6P435 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6P435 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6P435 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6P435 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6P435 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms