Protein–RNA interactions for Protein: Q6NYC8

PPP1R18, Phostensin, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R18Q6NYC8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PPP1R18Q6NYC8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R18Q6NYC8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R18Q6NYC8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R18Q6NYC8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R18Q6NYC8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R18Q6NYC8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R18Q6NYC8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R18Q6NYC8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R18Q6NYC8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R18Q6NYC8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R18Q6NYC8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R18Q6NYC8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R18Q6NYC8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R18Q6NYC8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R18Q6NYC8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R18Q6NYC8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R18Q6NYC8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R18Q6NYC8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R18Q6NYC8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R18Q6NYC8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R18Q6NYC8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R18Q6NYC8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R18Q6NYC8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R18Q6NYC8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R18Q6NYC8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R18Q6NYC8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R18Q6NYC8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R18Q6NYC8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R18Q6NYC8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP1R18Q6NYC8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP1R18Q6NYC8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP1R18Q6NYC8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP1R18Q6NYC8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP1R18Q6NYC8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP1R18Q6NYC8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP1R18Q6NYC8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP1R18Q6NYC8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP1R18Q6NYC8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP1R18Q6NYC8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms