Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFCAB12Q6NXP0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms