Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF544Q6NX49 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms