Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms