Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CREB3L3Q68CJ9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CREB3L3Q68CJ9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms