Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRCH2Q5VUJ6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms