Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COLEC12Q5KU26 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms