Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJD5

TMEM41B, Transmembrane protein 41B, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41BQ5BJD5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms