Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MICAQ29983 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MICAQ29983 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MICAQ29983 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MICAQ29983 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MICAQ29983 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MICAQ29983 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MICAQ29983 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MICAQ29983 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MICAQ29983 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MICAQ29983 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MICAQ29983 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MICAQ29983 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MICAQ29983 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MICAQ29983 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MICAQ29983 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MICAQ29983 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MICAQ29983 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MICAQ29983 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MICAQ29983 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MICAQ29983 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MICAQ29983 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MICAQ29983 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MICAQ29983 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MICAQ29983 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MICAQ29983 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MICAQ29983 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MICAQ29983 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MICAQ29983 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MICAQ29983 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MICAQ29983 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MICAQ29983 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MICAQ29983 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MICAQ29983 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MICAQ29983 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MICAQ29983 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MICAQ29983 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MICAQ29983 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MICAQ29983 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MICAQ29983 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MICAQ29983 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MICAQ29983 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MICAQ29983 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MICAQ29983 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MICAQ29983 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MICAQ29983 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MICAQ29983 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MICAQ29983 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MICAQ29983 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MICAQ29983 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MICAQ29983 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MICAQ29983 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MICAQ29983 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MICAQ29983 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MICAQ29983 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MICAQ29983 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MICAQ29983 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MICAQ29983 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MICAQ29983 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MICAQ29983 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MICAQ29983 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MICAQ29983 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MICAQ29983 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MICAQ29983 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MICAQ29983 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MICAQ29983 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MICAQ29983 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MICAQ29983 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MICAQ29983 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MICAQ29983 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MICAQ29983 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MICAQ29983 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MICAQ29983 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MICAQ29983 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MICAQ29983 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MICAQ29983 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MICAQ29983 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MICAQ29983 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MICAQ29983 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MICAQ29983 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MICAQ29983 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MICAQ29983 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MICAQ29983 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MICAQ29983 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MICAQ29983 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MICAQ29983 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MICAQ29983 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MICAQ29983 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MICAQ29983 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MICAQ29983 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MICAQ29983 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MICAQ29983 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MICAQ29983 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MICAQ29983 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MICAQ29983 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MICAQ29983 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MICAQ29983 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MICAQ29983 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MICAQ29983 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MICAQ29983 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms