Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LAMA3Q16787 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LAMA3Q16787 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.33■■□□□ 1
LAMA3Q16787 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LAMA3Q16787 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LAMA3Q16787 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LAMA3Q16787 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA3Q16787 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA3Q16787 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA3Q16787 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA3Q16787 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA3Q16787 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA3Q16787 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA3Q16787 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA3Q16787 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA3Q16787 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA3Q16787 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA3Q16787 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA3Q16787 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA3Q16787 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA3Q16787 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA3Q16787 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA3Q16787 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA3Q16787 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA3Q16787 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA3Q16787 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA3Q16787 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA3Q16787 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA3Q16787 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA3Q16787 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA3Q16787 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA3Q16787 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA3Q16787 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA3Q16787 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA3Q16787 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA3Q16787 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA3Q16787 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA3Q16787 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA3Q16787 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA3Q16787 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA3Q16787 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LAMA3Q16787 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA3Q16787 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA3Q16787 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA3Q16787 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA3Q16787 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA3Q16787 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA3Q16787 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA3Q16787 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA3Q16787 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LAMA3Q16787 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA3Q16787 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA3Q16787 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA3Q16787 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA3Q16787 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA3Q16787 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA3Q16787 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA3Q16787 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LAMA3Q16787 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA3Q16787 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA3Q16787 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA3Q16787 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA3Q16787 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA3Q16787 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA3Q16787 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA3Q16787 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LAMA3Q16787 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA3Q16787 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA3Q16787 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LAMA3Q16787 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA3Q16787 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA3Q16787 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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