Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 AC010618.2-201ENST00000596192 460 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 AC004672.2-201ENST00000537181 574 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
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FOXD1Q16676 LINC02270-202ENST00000515691 541 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
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FOXD1Q16676 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
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FOXD1Q16676 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
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FOXD1Q16676 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
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FOXD1Q16676 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
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FOXD1Q16676 AL096869.2-202ENST00000557007 1237 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FOXD1Q16676 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
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