Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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SEC23BQ15437 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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SEC23BQ15437 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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SEC23BQ15437 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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SEC23BQ15437 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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SEC23BQ15437 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC23BQ15437 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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