Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms