Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PSMD6Q15008 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PSMD6Q15008 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PSMD6Q15008 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PSMD6Q15008 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PSMD6Q15008 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PSMD6Q15008 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PSMD6Q15008 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD6Q15008 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD6Q15008 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD6Q15008 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD6Q15008 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD6Q15008 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD6Q15008 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
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