Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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COL19A1Q14993 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
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COL19A1Q14993 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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COL19A1Q14993 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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COL19A1Q14993 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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COL19A1Q14993 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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