Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
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