Protein–RNA interactions for Protein: Q13885

TUBB2A, Tubulin beta-2A chain, humanhuman

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Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2AQ13885 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TUBB2AQ13885 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBB2AQ13885 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBB2AQ13885 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBB2AQ13885 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBB2AQ13885 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBB2AQ13885 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBB2AQ13885 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBB2AQ13885 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBB2AQ13885 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBB2AQ13885 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBB2AQ13885 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBB2AQ13885 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBB2AQ13885 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBB2AQ13885 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
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