Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

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Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTR4Q13639 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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