Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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