Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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