Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPP1R1AQ13522 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPP1R1AQ13522 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPP1R1AQ13522 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPP1R1AQ13522 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPP1R1AQ13522 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPP1R1AQ13522 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPP1R1AQ13522 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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